Suomen Pelastakaa Lapset ry oli tehnyt jo vuosikymmeniä yhteistyötä kansainvälisen Save the Children –organisaation kanssa ennen liittymistään sen varsinaiseksi jäseneksi vuonna 1997. Esimerkiksi 1960-luvulla alkaneen kummilapsitoiminnan kaikki kummilapset suomalainen järjestö sai STC:n kautta.

Erillisen historiansa vuoksi suomalaisen Pelastakaa Lapset ry:n ja kansainvälisen allianssin toiminnassa on ollut eroavuuksia. Toisin kuin maailmanlaajuinen järjestö, suomalainen Pelastakaa Lapset tekee myös käytännön lastensuojelutyötä ja hoitaa kansainvälisiä adoptioita. 

Vuonna 2004 kattojärjestön jäsenkokouksessa alettiin valmistella ensimmäistä kaikille jäsenmaille yhteistä toimintastrategiaa kansainvälisiä ohjelmia varten. Vuonna 2015 kattojärjestön strategiaa laajennettiin sovellettavaksi myös jäsenjärjestöjen kotimaisiin toimintoihin.